Nawa południowa wybudowana w pierwszej połowie XIII wieku. Znajdują się tu dwa portale z 1660 roku prowadzące do krużganków. Wschodni dla braci kapłanów i zachodni dla braci konwersów. Podobno w portalu dla braci kapłanów, w którym postawiono stół król polski i szwedzki nie chcąc się ze sobą spotykać podpisali pokój oliwski.